全外显子组序列分析新生儿FGFR2基因相关疾病1例

• 作者: 刘博 周文浩 孙碧君 杨琳 梅枚 樊子川 王慧君 黎籽秀
• 来源期刊: 中国循证儿科杂志
• 关键词: FGFR2基因 突变 全外显子序列检测 FGFR2相关综合征
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 34-39
• 页数: 6页
• 字数: 4784字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-5501.2015.01.006

摘要

目的 通过对1例新生儿期特殊面容、神经系统结构畸形患儿进行全外显子组序列检测分析,旨在为该患儿寻找潜在的致病原因.方法 纳入1例在复旦大学附属儿科医院(我院)新生儿病房住院期间未能明确诊断的多发畸形患儿,主要临床表型为前额突出、腭弓高、耳位低、枕部较平,双侧脑室扩大、透明隔部分缺如、胼胝体发育异常,采用SureSelctHuman All Exon捕获试剂盒和Illumina HiSeq2000测序平台,行全外显子组序列检测.数据分析采用复旦大学附属儿科医院转化中心所建立的高通量测序数据分析流程.采用Sanger测序进行验证.结果 患儿全外显子组序列检测数据,共检测到79 064个变异,经过质量控制筛选、变异频率筛选、变异分类筛选,剩余645个变异.在进一步分析中,645个变异中有159个其所在基因在OMIM数据库及HGMD数据库与疾病相关.从3个已经报道的突变位点中锁定致病突变为FGFR2基因(NM_000141)c.C1040G,p.S347C.Sanger测序在家系内验证该位点为新发(de novo)突变.结论 采用全外显子组序列检测,明确诊断FGFR2相关疾病1例.并且结合我院已经建立的高通量测序数据分析和临床诊断流程,为新生儿多发畸形寻找潜在的致病基因提供了快速、高效的方法.