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抗性稗草1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶基因的克隆与表达分析
抗性稗草1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶基因的克隆与表达分析
作者:
张自常
李永丰
杨霞
管荣展
董明超
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
稗草
1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶
基因克隆
点突变
表达
摘要:
【目的】克隆稗草(Echinochloa crus-galli)乙烯生物合成途径关键酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶基因(EcACO),对其进行表达分析和酶活性测定,以探究稗草抗二氯喹啉酸的机理。【方法】根据转录组测序所得 EcACO部分序列设计引物,分别从二氯喹啉酸的抗性和敏感型稗草中克隆 EcACO的全长序列,用DNAman以及GeneDOC等软件进行序列分析。用qRT-PCR方法分析抗性和敏感性稗草间的EcACO表达水平差异。最后分别将抗性和敏感性稗草EcACO的开放阅读框(ORF)序列连接至原核表达载体pMAL-c5x中,并转化至大肠杆菌菌株BL21,经终浓度为0.4 mmol·L-1的IPTG于18℃诱导16 h后,检测EcACO蛋白的表达情况。采用MBP吸附柱分离纯化EcACO蛋白后,通过测定乙烯释放量,测定抗性和敏感稗草EcACO蛋白间的活性差异。【结果】克隆得到抗性稗草和敏感稗草EcACO,其编码区序列长度为936 bp,预测蛋白含311个氨基酸残基,蛋白分子量大小和理论等电点分别为35 kD和5.4。序列比对表明,抗性稗草EcACO氨基酸序列与粟(Setaria italica)、玉米(Zea mays)、高粱(Sorghum bicolor)同源性分别为93%、92%和91%;与敏感性稗草EcACO相比,抗性稗草EcACO的氨基酸序列存在5个突变位点,其中有3个突变位点位于保守功能域上。qPCR分析显示,EcACO在抗性和敏感性稗草中并无明显的表达水平差异。原核蛋白表达和酶活性测定结果表明,敏感型稗草MBP:EcACO融合蛋白单位时间内产生的乙烯释放量是抗性稗草MBP:EcACO融合蛋白的2.15倍,因而该基因可能解释了稗草的抗药性机理。【结论】从抗二氯喹啉酸的稗草中克隆了EcACO,发现了与抗性相关的5个氨基酸突变位点,其中的3个位点突变位于保守结构域,这可能是引起乙烯释放速率降低以及稗草产生二氯喹啉酸抗性的原因。
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篇名
抗性稗草1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶基因的克隆与表达分析
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
稗草
1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶
基因克隆
点突变
表达
年,卷(期)
2015,(20)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
4077-4085
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2015.20.009
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
管荣展
南京农业大学农学院
30
306
10.0
16.0
2
李永丰
江苏省农业科学院植物保护研究所
40
454
12.0
19.0
3
张自常
江苏省农业科学院植物保护研究所
19
107
6.0
9.0
4
杨霞
江苏省农业科学院植物保护研究所
14
66
4.0
7.0
5
董明超
南京农业大学农学院
3
14
2.0
3.0
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节点文献
稗草
1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶
基因克隆
点突变
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研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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