阳春砂磷酸甲羟戊酸激酶的基因克隆与表达谱分析

• 作者: 吴秋红 杨恩泽 王峰 陆颖锶
• 来源期刊: 暨南大学学报（自然科学与医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 磷酸甲羟戊酸激酶 阳春砂 萜类化合物 基因克隆 表达谱分析
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 95-101
• 页数: 7页
• 分类号: R282.5
• 字数: 4518字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11778/j.jdxb.2015.02.001

摘要

目的：为了了解阳春砂磷酸甲羟戊酸激酶（PMK）的功能与表达特性，根据阳春砂的转录组注释设计引物，PCR 克隆阳春砂甲羟戊酸途径中的关键酶磷酸甲羟戊酸激酶基因的编码区 cDNA，使用生物信息学方法对其编码的蛋白进行相似性检索及同源序列比对，构建进化树，预测二级及三级结构并分析其功能，探索其各器官中的表达差异．结果：获得了全长1539 bp 的编码阳春砂 PMK 的 cDNA 序列，命名为 AvPMK （GenBank 登录号：KF569902），编码由512个氨基酸组成的磷酸甲羟戊酸激酶，该蛋白含有 GHMP 激酶超家族特异的 N －保守区域、C －保守区域和 ATP 结合位点 Gly-X-Gly-XX-Ala．AvPMK 与其他植物的 PMK 氨基酸相似性达61％～69％，进化树结果显示其与二穗短柄草（Brachypodium distachyon）等单子叶植物具有较近的亲缘关系．AvPMK 蛋白包含14个α-螺旋（Alpha helix），占37.1％；16个β链（Beta strand），占15.6％；32个无规则卷曲结构，占47.3％，无跨膜结构域，其3级结构含有一个催化反应的口袋状结构域．实时荧光定量 PCR 结果显示 AvPMK 基因在叶中表达量较高，茎、根中表达量相对较低．结论：首次从阳春砂仁中扩增磷酸甲羟戊酸激酶的基因片段，为分析其基因表达特性及其在砂仁萜类生物合成中的功能奠定基础．

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王峰	暨南大学药学院中药药效物质基础及创新药物研究广东省高校重点实验室	33	133	7.0	10.0
2	吴秋红	暨南大学药学院中药药效物质基础及创新药物研究广东省高校重点实验室	5	25	3.0	5.0
3	杨恩泽	暨南大学药学院中药药效物质基础及创新药物研究广东省高校重点实验室	2	11	1.0	2.0
4	陆颖锶	暨南大学药学院中药药效物质基础及创新药物研究广东省高校重点实验室	1	10	1.0	1.0