青天葵甲羟戊酸激酶基因的编码蛋白预测和表达分析

• 作者: 何瑞 詹若挺 黄琼林
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 医学
• 关键词: 青天葵 甲羟戊酸激酶 生物信息学 表达量
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1099-1104
• 页数: 6页
• 分类号: R932
• 字数: 3573字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2015.06.014

摘要

甲羟戊酸途径(mevalonic acid,MVA)是植物三萜类化合物生物合成的主要途径,而甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase,MVK)是MVA途径中的关键限速酶之一.根据前期获得的青天葵[Nervilia fordii(Hance)Schltr.]转录组数据,采用生物信息学方法对青天葵MVK基因编码蛋白的理化特性、功能结构域、二级结构、信号肽、跨膜结构域等进行预测,并采用RPKM法分析该基因在青天葵球茎和叶片的表达量.结果表明,NfMVK基因编码含有383个氨基酸的稳定型亲水性、酸性蛋白质,与其他植物MVK蛋白同源性可达70％.NfMVK蛋白分子量为41.29 ku,含有甲羟戊酸激酶功能域,归属于GHMP Kinase超级家族.该蛋白没有任何信号肽、转运肽和跨膜结构域,二级结构为混合型结构的蛋白质.NfMVK基因在青天葵中的表达趋势为:球茎＞叶片.该结果可为后续利用MVK基因调控青天葵三萜类活性成分的合成提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何瑞	广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心	32	139	6.0	11.0
3	詹若挺	广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心	94	538	12.0	19.0
7	黄琼林		9	51	5.0	6.0