青天葵PAL基因序列特征和表达分析

• 作者: 何瑞 詹若挺 黄琼林
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 苯丙氨酸解氨酶 青天葵 序列特征 表达 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺·林学
• 页码范围: 104-108
• 页数: 5页
• 分类号: S567.23
• 字数: 3340字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2016.02.021

摘要

在前期完成的青天葵(Nervilia fordii)转录组测序数据的基础上,采用生物信息学方法对3个青天葵PAL基因家族成员(NfPAL1、NfPAL2和NfPAL3)的cDNA序列及其编码蛋白质的氨基酸序列进行特征分析,并计算这些基因在青天葵叶片和球茎中的表达量.结果表明,从转录组数据中获得的3个青天葵PAL基因家族成员cDNA序列长度为1 743～2 091 bp,编码581～697个氨基酸.这些PAL基因编码包含苯丙氨酸解氨酶多功能域,并且不含跨膜结构域、信号肽和转运肽的亲水性稳定蛋白.3个青天葵PAL基因在青天葵中的表达呈组织特异性,其中,NfPAL1和NfPAL3在球茎中的表达量较高,而NfPAL2在叶片中具有较高的表达水平.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何瑞	广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心	32	139	6.0	11.0
3	詹若挺	广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心	94	538	12.0	19.0
7	黄琼林		9	51	5.0	6.0