镇江地区儿童群体博卡病毒感染情况及基因组遗传特征

• 作者: 于魁魁 张潇丹 朱桂芳 章震花 谢凯
• 来源期刊: 现代检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人博卡病毒 分子流行病学 系统进化分析 基因型
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 67-71
• 页数: 5页
• 分类号: R373.1|Q786
• 字数: 3094字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7414.2015.06.019

摘要

目的 了解镇江地区呼吸道和胃肠道疾病患儿博卡病毒(HBoV)流行状况,并通过对代表毒株的全基因组测序了解博卡病毒遗传特征.方法 收集2010年1月～2011年12月期间镇江地区156份呼吸道疾病患儿鼻咽分泌物样品和310份急性胃肠炎患儿粪便样品,采用PCR方法检测HBoV基因;选取3株镇江地区HBoV代表毒株,测序获取全基因组序列,采用CLUSTAL和MEGA4.0等软件进行序列同源性及系统发育分析.结果 HBoV在鼻咽分泌物样品中的检出率为2.56％,在粪便样品检出率为3.55％;HBoV基因序列均与GenBank中提交的HBoV-1型毒株高度同源(＞95％),且与上海地区的7株HBoV-1和重庆地区的3株HBoV-1同源性最高;系统进化分析结果显示,3株HBoV-1代表株聚类在三个不同的类群中,其中ZJ92与来自中国香港的HBoV毒株HK24及上海的HBoV毒株SH8遗传关系最近,ZJ42与来自泰国的毒株CU25遗传关系最近,而ZJ68与来自上海的R3080522001和SH1亲缘关系最近.结论 HBoV-1为镇江地区HBoV主要流行基因型;系统进化分析显示镇江地区的HBoV-1毒株与重庆和上海的毒株有共同的分子起源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢凯	徐州市中心医院检验科	5	16	2.0	4.0
2	于魁魁	徐州市中心医院检验科	3	2	1.0	1.0
3	朱桂芳	江苏大学附属第四人民医院检验科	4	4	1.0	2.0
4	章震花	江苏大学附属第四人民医院检验科	3	4	1.0	2.0
5	张潇丹	江苏大学基础医学与医学技术学院	1	0	0.0	0.0