原文服务方: 广东医科大学学报       
摘要:
目的 生物信息学预测并实验验证mmu-miR-107的靶基因.方法 利用TargetScan、miRanda、Clip-seq及miRDB预测mmu-miR-107靶基因,分别构建含有候选靶基因(Cacna2d1、Capza2、Celsr2、Csnk1g2和Tmem4 7)3'UTR的荧光素酶报告载体pGL3,通过双荧光素酶检测系统、时实定量PCR进一步验证预测的靶基因.结果 成功构建分别含有5个候选靶基因3'UTR的荧光素酶报告载体;与miR-NC组相比,miR-107组共转染pGL3-Cacna2dl3'UTR、pGL3-Cavl3'UTR的荧光素酶活性均显著下降(P<0.01或0.05);其余候选靶基因Capza2、Celsr2、Csnk1g2和Tmem47的共转染组荧光素酶活性差异无统计学意义(P>0.05);过表达或下调C2C12细胞的miR-107,可有效降低或提高Cacna2d1的mRNA水平表达(P<0.05).结论 初步验证Cacna2d1是mmu-miR-107的靶基因.
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文献信息
篇名 mmu-miR-107调控Cacna2d1基因的mRNA水平
来源期刊 广东医科大学学报 学科
关键词 mmu-miR-107 生物信息学 靶基因 Cacna2d1
年,卷(期) 2015,(5) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 533-537
页数 5页 分类号 R34
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1005-4057.2015.05.008
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研究主题发展历程
节点文献
mmu-miR-107
生物信息学
靶基因
Cacna2d1
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广东医科大学学报
双月刊
2096-3610
44-1731/R
大16开
广东湛江文明东路2号
1983-01-01
中文
出版文献量(篇)
6882
总下载数(次)
0
总被引数(次)
22989
相关基金
广东省医学科研基金
英文译名:
官方网址:http://www.medste.gd.cn/Html/sciedu/Class1189/Class1201/17922820070507155200.html
项目类型:重点项目、面上项目、青年基金项目
学科类型:
论文1v1指导