细菌σ54启动子序列分析与预测

• 作者: 丁辉 林昊 邓恩泽 陈伟
• 来源期刊: 电子科技大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 细菌 保守性 位置权重矩阵 启动子
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 生物电子学
• 页码范围: 147-149
• 页数: 3页
• 分类号: Q61
• 字数: 2638字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-0548.2015.01.025

摘要

对实验确定的168条σ54启动子序列进行保守性分析，获得两个保守的区域?24区域和?12区域，均为最保守的功能元件。选取保守性最大的17个保守位点的三联体频数作为参数，引入伪计数构建位置权重矩阵，对168条σ54启动子进行预测，分别从编码区和汇聚非编码区共选取168条序列组成阴性集。使用Jackknife交叉验证法对模型进行检验，整体准确度达到82.0%，为σ54启动子的理论和实验研究提供新信息。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈伟	河北联合大学基因组学与计算生物学中心	20	34	4.0	5.0
2	林昊	电子科技大学生物信息学中心	10	13	2.0	2.0
3	丁辉	电子科技大学生物信息学中心	4	3	1.0	1.0
4	邓恩泽	电子科技大学生物信息学中心	1	1	1.0	1.0