基于线粒体COI和16S rRNA基因研究3个地理群体黑龙江河蓝蛤的遗传多样性

• 作者: 严加坤 侯丫 刘志鸿 吴彪 周丽青 孙超 杨爱国 董春光
• 来源期刊: 海洋科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黑龙江河蓝蛤(Potamocorbula amurensis) 线粒体 16S rRNA COI 遗传分化
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 39-45
• 页数: 7页
• 分类号: S917.4|Q786
• 字数: 4421字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11759/hykx20130603002

摘要

采用通用引物对辽宁盘锦、辽宁大连、山东日照的3个地理群体黑龙江河蓝蛤(Potamocorbula amurensis)COI和16S rRNA序列进行扩增、测序分析,得到30条658bp的COI基因部分序列和27条450 bp的16S rRNA基因部分序列。其中COI和16S rRNA基因部分序列T、C、A、G和A+T的平均含量分别为45.4%和32.0%、13.5%和13.3%、20.7%和29.3%、20.4%和25.3%、66.1%和61.3%, AT含量高于GC含量,这与其他软体动物门动物的COI和16S rRNA的观测结果相近。COI和16S rRNA分别检测到了24个单倍型、43个核苷酸多态位点和9个单倍型、19个核苷酸多态性位点。AMOVA分析表明,3个群体间COI和16S rRNA部分基因总遗传分化系数分别为Fst =0.0090(P<0.001)和Fst =0.0674(P<0.001),群体内遗传分化远大于群体间、群体内存在较高的遗传分化。用 NJ 法构建分子进化树,3个地理群体的黑龙江河蓝蛤聚为一个族群,有少数个体和其他群体的个体聚在一起。