整合序列与蛋白相互作用特征的亚细胞定位预测

• 作者: 冯焕清 李骜 王强 王明会 龚艺
• 来源期刊: 电子科技大学学报
• 学科: 工学
• 关键词: 生物信息学 K近邻算法 蛋白质相互作用 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 生物电子学
• 页码范围: 467-470
• 页数: 4页
• 分类号: TP391|Q71
• 字数: 2566字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-0548.2015.03.026

摘要

提出了一种基于序列和PPI特征的距离公式，可综合序列氨基酸组成和PPI对象、强弱等信息对两个蛋白质的相似性进行表征，并在此基础上提出了一种用于蛋白质亚细胞定位预测的K近邻算法。利用留一法对性能进行了评估，结果显示，在序列基础上加入PPI特征，可明显有助于亚细胞定位的预测；同时基于上述距离的K近邻算法也优于使用相同特征的SVM算法，表明该算法可以对蛋白质的亚细胞定位信息进行准确有效的预测。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯焕清	中国科学与技术大学信息科学技术学院	154	1499	19.0	30.0
2	王强	中国科学与技术大学信息科学技术学院	267	5471	42.0	69.0
3	王明会	中国科学与技术大学信息科学技术学院	14	67	5.0	8.0
4	李骜	中国科学与技术大学信息科学技术学院	15	73	6.0	8.0
5	龚艺	中国科学与技术大学信息科学技术学院	1	7	1.0	1.0