基于线粒体DNA D-loop区全序列分析大围山微型鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究

• 作者: 唐修君 苏一军 葛庆联 贾晓旭 陆俊贤 顾荣 高玉时
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大围山微型鸡 线粒体DNA D-loop区 系统发育关系 起源
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 656-660
• 分类号: S831.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/j.issn.1000-2030.2015.04.020

摘要

[目的]探究大围山微型鸡的遗传多样性和起源.[方法]对30只大围山微型鸡线粒体DNA(mitochondrial genome,mtDNA) D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,并结合GenBank已登录红色原鸡的D-loop区全序列,运用现代生物信息学方法进行数据处理.[结果]试验结果表明:大围山微型鸡mtDNA D-loop区全长1 231～1 232bp,1 231 bp单倍型在859 bp处存在C碱基缺失.核苷酸多样性(Pi)为0.004 43±0.000 14,单倍型多样性(Hd)为0.685±0.079,核苷酸平均差异数(K)为5.448.在30只个体中,共发现18处单核苷酸多态位点,6种单倍型.系统发育分析发现,6种单倍型可以分为A、B、D和E4个分支,其中A和B为主要分支.A和B分支各有2种单倍型,D和E分支均只有1种单倍型.A和B分支与红色原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)聚为一类.[结论]大围山微型鸡mtDNA D-loop区有丰富的多态性,并且有多个母系起源,红色原鸡滇南亚种在大围山微型鸡形成过程中贡献最大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆俊贤		41	149	7.0	11.0
2	高玉时		52	315	7.0	17.0
3	苏一军		18	95	6.0	9.0
4	葛庆联		29	118	6.0	9.0
5	顾荣		16	74	6.0	8.0
6	贾晓旭		28	82	6.0	8.0
7	唐修君		32	93	6.0	8.0