基于线粒体基因组D-loop区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源进化关系

• 作者: 唐修君 唐梦君 樊艳凤 苏一军 葛庆联 贾晓旭 陆俊贤 顾荣 高玉时
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 安义瓦灰鸡 线粒体DNA D-loop区 系统发育关系 起源
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 940-944
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2015.07.011

摘要

本研究旨在探究江西安义瓦灰鸡(Gallus gallus domestiaus)的遗传多样性和起源.对30只安义瓦灰鸡线粒体基因组(mitochondrial genome,mtDNA) D-loop区全序列的进行PCR扩增和测序(GenBank 登录号:KP893677～KP893682),并结合GenBank中红色原鸡的D-loop区序列,分析安义瓦灰鸡线粒体多态性及其起源.结果发现,安义瓦灰鸡mtDNA D-loop区全长1 231～1 232bp,核苷酸多样性(Pi)为(0.006 13±0.000 14),单倍型多样性(Hd)为(0.837±0.027).在30只个体中,共发现18处单核苷酸多态位点,6种单倍型.系统发育分析发现,6种单倍型可以分为A、B、C3个分支,其中C为主要分支,有3种单倍型,A分支有1种倍型,B分支有2种倍型.A和B分支与红色原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)聚为一类,C分支与4个原鸡亚种聚为一类.研究结果表明,安义瓦灰鸡mtDNA D-loop区有丰富的多态性,并且有多个母系起源,从分子水平上为安义瓦灰鸡的遗传资源保护和开发利用提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆俊贤		41	149	7.0	11.0
2	高玉时		52	315	7.0	17.0
3	苏一军		18	95	6.0	9.0
4	葛庆联		29	118	6.0	9.0
5	顾荣		16	74	6.0	8.0
6	樊艳凤		21	47	4.0	6.0
7	贾晓旭		28	82	6.0	8.0
8	唐修君		32	93	6.0	8.0
9	唐梦君		23	53	5.0	7.0