京海黄鸡翅重性状的全基因组关联分析

• 作者: 张涛 张跟喜 王文浩 王永娟 王金玉 韩昆鹏
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 简化基因组测序 翅重 全基因组关联分析 京海黄鸡
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 6-12
• 页数: 7页
• 分类号: S831.5
• 字数: 3798字
• 语种: 中文

摘要

试验旨在揭示京海黄鸡翅重性状的遗传基础,寻找可用于京海黄鸡翅重性状改良的分子标记.本研究以京海黄鸡核心群母鸡为基础,测定了屠宰时的单侧翅重,利用简化基因组测序技术进行全基因组关联研究(GWAS),检测与翅重相关的SNPs位点.结果表明:共检测到7个与翅重相关的SNPs位点,其中,rs2011502599、rsz26128672、rs1830645和rs475641139 4个SNP位点达到全基因组显著水平(P＜5.5E-07),rs476249085、rs475679707和rs473712263 3个SNP位点达到全基因组潜在显著水平(P＜ 1.1 E-05);筛选每个显著SNP周围1Mb区域内的基因,共找到7个可能的候选基因,分别为PGO2、SMARCA2、ZNF302、QDPR、FBXL5、LDB2、PPARGCIA 7个基因;使用GO数据库对7个候选基因的细胞组分、分子功能和参与的生物进程进行分析发现,4个SNPs集中分布在4号染色体上的73.71～76.25Mb的区域内.表明PGO2、SMARCA2、ZNF302、QDPR、FBXL5、LDB2、PPARGC1A 7个基因和4号染色体73.71～76.25Mb区域可能为影响京海黄鸡翅重性状的重要候选基因和区域.