京海黄鸡4个肉质性状的全基因组关联分析

• 作者: 凌姣姣 张向前 张跟喜 樊庆灿 王永娟 王金玉 董新龙
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 京海黄鸡 全基因组关联分析 肉质性状 单倍型
• 年，卷（期）: 2015,（21）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 9-14
• 页数: 6页
• 分类号: S831.2
• 字数: 3735字
• 语种: 中文

摘要

肉质性状对于家禽产业来说非常重要.为了获得影响鸡肉质性状的SNPs以及候选基因,本研究使用Illumina公司的鸡60K SNP芯片,对京海黄鸡的4个肉质性状(FLM、FBM、PLM、PBM)进行全基因组关联分析 结果表明:共鉴定出9个与肉质性状显著关联的SNPs位点,其中,有2个SNPs达到5％Bonferroni全基因组显著水平(P＜1.8E-6),7个SNPs位点达到5％ Bonferroni全基因组潜在显著水平(P＜3.59E-6).9个SNPs定位于LOC101747478、CBLN2、HPGDS、SETD2、A NKRD46、ZFPM2和GRM4 7个基因的附近或内部,该7个基因可能为影响京海黄鸡4个肉质性状的重要候选基因.构建5 650种单倍型,单倍型分析表明,只有一种单倍型与FLM性状显著相关.以上结果显示,本研究发现的9个SNPs和7个基因可能为影响京海黄鸡4个肉质性状的重要候选标记和基因.