临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布及其与毒力基因的关系

• 作者: 杨海燕 段广才 王琳琳 王颖芳 王鹏飞 郗园林 郭向娇
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: 志贺菌 CRISPR/Cas系统 聚合酶链式反应 插入序列 毒力基因
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 医学微生物
• 页码范围: 543-549
• 语种: 中文
• DOI: 10.13344/j.microbiol.china.140529

摘要

[目的]了解临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布特征并分析其与毒力基因的关系.[方法]以聚合酶链式反应(PCR)方法,采用10对引物分别对57株临床分离志贺菌中CRISPR1、cas2-cas1、cas6e-cas5、cas7、cse2、cse1-cas3基因和毒力基因ipaH、ial、ipaBCD、virA进行检测.对CRISPR1的PCR结果进行测序,并用CRISPR finder在线软件对CRISPR1基因座进行分析.通过卡方检验初步分析CRISPR/Cas系统与毒力基因的关系.[结果]测序结果显示,CRISPR1基因座中间隔序列数目较少且在不同菌株间一致性较高;57株志贺菌中,84.2％(48/57)的志贺菌中可检测到CRISPR/Cas系统,其中68.8％ (33/48)的志贺菌中cas6e-cas5基因或(和)cse2基因中发现插入序列;毒力基因ipaH、ial、virA、ipaBCD的检出率依次为100％、100％、98.2％和87.7％;毒力基因ipaBCD的阳性率与活性CRISPR/Cas系统的分布无关(P＞0.05).[结论]CRISPR/Cas系统广泛存在于临床分离志贺菌中;部分cas基因中有插入序列;并未发现志贺菌中活性CRISPR/Cas系统与毒力基因的分布有关.