牦牛 MITF-M 基因序列分析及其在皮肤组织中表达水平

• 作者: 张建一 梁春年 沈友明 裴杰 郭宪 阎萍
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 牦牛 MITF-M基因 克隆 生物信息学分析 表达水平
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q78
• 字数: 5579字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2015.03.001

摘要

研究牦牛MITF-M基因编码区序列及其编码蛋白的结构，以及其在皮肤组织中mRNA的表达水平，探讨MITF-M基因与牦牛毛色形成相关性，以期为揭示牦牛毛色形成分子机理奠定基础。采用RT-PCR技术扩增，成功获得了牦牛MITF-M基因编码区序列。采用生物信息学方法，预测分析MITF-M基因及其编码蛋白的基本理化性质、二级结构等；采用半定量PCR检测技术，检测出MITF-M基因mRNA在牦牛各组织器官中表达水平；通过荧光定量PCR技术检测出在牦牛不同颜色皮肤组织中MITF-M基因mRNA表达水平。结果表明，扩增得到的MITF-M基因的编码区是一条长为1460 bp的DNA序列。将牦牛的MITF-M基因序列命名为YAK MITF-M，并且在NCBI数据库中注册该基因的登录号为KM985448。牦牛MITF-M序列基因含有一个长度为1242 bp的开放性阅读框，编码413个氨基酸，二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主，β折叠和延伸链较少。 MITF-M基因编码产物氨基酸邻接系统树表明，牦牛MITF-M与黄牛、绵羊等物种的MITF-M氨基酸具有高度相似性。在牦牛各组织器官中，MITF-M基因mRNA仅在皮肤组织中特异性表达，且在不同毛色牦牛皮肤组织中，MITF-M在黑色被毛皮肤组织中mRNA表达量显著高于白色被毛皮肤组织（P＜0．01）。