细菌基因组序列中ε-聚赖氨酸合成酶的生物信息学识别与分析

• 作者: 欧竑宇 毕德玺 王静 谭之磊 贾士儒
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: ε-聚赖氨酸 ε-聚赖氨酸合成酶 生物信息学识别
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 点评文章
• 页码范围: 2495-2504
• 语种: 中文
• DOI: 10.13344/j.microbiol.china.150170

摘要

[目的]ε-聚赖氨酸的合成由ε-聚赖氨酸合成酶(Pls)所控制,考察Pls在细菌中的分布和保守的序列特征.[方法]基于Pls的作用机制,在蛋白序列中识别与底物结合和缩合相关的结构域,以及决定底物特异性的氨基酸残基,进而在已测序基因组中预测Pls.[结果]发现110个已测序的基因组中编码113个预测的Pls,主要分布在放线菌中,也在两株革兰氏阴性菌中被发现.一些亲缘性较高菌株的Pls一致性较高.[结论]Pls在放线菌中可能广泛分布.Pls的腺苷化、巯基化和底物缩合结构域有相对较高的序列保守性,而跨膜结构域和Linker区相对不保守.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贾士儒	天津科技大学工业微生物教育部重点实验室	194	1848	22.0	31.0
2	谭之磊	天津科技大学工业微生物教育部重点实验室	37	232	9.0	13.0
3	王静	上海交通大学微生物代谢国家重点实验室	154	968	14.0	25.0
4	欧竑宇	上海交通大学微生物代谢国家重点实验室	6	16	3.0	4.0
5	毕德玺	上海交通大学微生物代谢国家重点实验室	2	8	2.0	2.0