猪STARD3NL基因克隆和表达谱分析

• 作者: 李艳平 贾坤航 邢晋祎
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 STARD3NL基因 克隆 猪圆环2型病毒
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1678-1685
• 页数: 8页
• 分类号: S828|S813.3
• 字数: 5216字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.09.026

摘要

本研究旨在克隆猪STARD3NL (STARD3 N-terminal like protein)基因,对其基因结构进行分析,并研究该基因在猪不同组织中的表达特性.采用5 '和3'-RACE以及RT-PCR方法克隆猪STARD3NL基因,利用生物信息学方法预测蛋白结构,应用qRT-PCR技术检测组织表达特性.结果表明,猪STARD3NL基因的cDNA序列长度为1 319 bp(GenBank登录号:HQ634946),编码235个氨基酸,该氨基酸序列与其他物种相比一致性较高;进化树分析表明,猪STARD3NL氨基酸序列与牛和绵羊的关系较近,与斑马鱼的进化关系最远.ST ARD3NL氨基酸序列包含保守的MENTAL结构域,为疏水蛋白,包含4个跨膜螺旋区;二级结构主要是α-螺旋,占60％;该蛋白不存在信号肽,不是分泌蛋白;亚细胞定位显示,该蛋白存在于内质网的概率为39.1％.qRT-PCR分析表明,STARD3NL基因在所检测猪的14种组织均有表达,在肝中表达水平最高,在眼肌中的表达水平最低;莱芜猪和大长猪被圆环病毒感染后,STARD3NL基因在2种猪肺组织中的表达水平差异不显著(P＞0.05).研究结果将为进一步研究STARD3NL基因的结构和功能以及猪抗病育种提供资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢晋祎	临沂大学生命科学学院	20	13	2.0	2.0
2	贾坤航	临沂大学生命科学学院	5	5	2.0	2.0
3	李艳平	山东农业大学动物科技学院	3	8	2.0	2.0