凡纳滨对虾Hox基因及其在早期发育中表达模式的研究

• 作者: 孙晓晴 张晓军 李富花 相建海 袁剑波 隗健凯
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: Hox基因 凡纳滨对虾 甲壳动物 早期发育 表达模式
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 52-62
• 页数: 11页
• 分类号: Q959.223
• 字数: 9248字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20140323

摘要

Hox基因是决定动物形态多样性的关键基因,同一类型Hox基因的同源异型结构域(Homeodomain)序列及其功能在进化上高度保守.甲壳动物是仅次于昆虫的第二大类节肢动物,但有关其Hox基因研究在深度和广度上都远远不如昆虫.本研究首先通过RNA-Seq测序技术和生物信息学方法分析发现在凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)中存在13种Hox基因,分别为Lvlab、Lvpb、Lvhox3、Lvdfd、Lvscr、Lvftz、Lvantp、Lvub、LvabdA、LvabdB、Lvmsx、Lvmnx和Lvdll;然后根据RNA-Seq数据,克隆获得了这13条基因的开放阅读框(ORF)的cDNA序列,并对其序列结构、早期发育表达模式及同源关系进行了初步分析.序列分析显示这些Hox基因的结构非常保守,同源比对显示同一类型的Hox基因的氨基酸序列在不同物种之间具有较高的保守性;表达模式分析结果发现,不同Hox基因在早期发育过程中的表达模式不同,从囊胚期开始,按时序表达的先后顺序基本为Lvmsx、Lvlab、Lvpb、Lvhox3、Lvdfd、Lvscr、Lvftz、L vmnx、Lvdll、Lvantp、L vub、Lvabd、LvabdB.根据各Hox基因表达时期对应的对虾胚胎和幼体发育情况,初步推测了这些基因在凡纳滨对虾的发育过程中可能的功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张晓军	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室	21	330	10.0	18.0
2	李富花	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室	30	262	10.0	15.0
3	袁剑波	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室	2	10	2.0	2.0
4	孙晓晴	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室	1	3	1.0	1.0
8	隗健凯	中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室	1	3	1.0	1.0