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松江鲈(Trachidermus fasciatus)髓样分化因子MyD88基因克隆与组织表达分析
松江鲈(Trachidermus fasciatus)髓样分化因子MyD88基因克隆与组织表达分析
作者:
于珊珊
刘春影
张秋霞
毕彩红
祝茜
陈学昭
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
松江鲈
MyD88
基因克隆
先天免疫
LPS
摘要:
髓样分化因子(MyD88)是TOLL样受体介导的信号通路中的一个关键接头分子,通过激活核转录因子(nuclear factor-kappaB,NF-κB)而参与机体的先天免疫。克隆了松江鲈的MyD88基因(命名为TfMyD88),并对该基因进行了生物信息学和表达模式分析。结果显示,TfMyD88 cDNA序列全长1555 bp,5' UTR长89 bp,3' UTR长599 bp;开放阅读框长度为867 bp,编码288个氨基酸。SMART软件预测TfMyD88分子的N端为一个保守的死亡结构域(death domain,DD),C端存在典型的TIR (Toll/interleukin-1 receptor)结构域。TfMyD88与其它脊椎动物MyD88的氨基酸相似性达57.58%-82.64%,系统进化树分析表明TfMyD88与同属鲈形总目的花鲈和鳜鱼聚在一起,所有鱼类MyD88聚为一支。Real-time PCR检测显示TfMyD88广泛表达于松江鲈各组织,但在鳃中的相对表达量最高;其次为脾脏和皮肤。LPS(lipopolysaccharide)刺激后,TfMyD88在松江鲈的血液、肝脏、皮肤、脾脏均出现明显上调。刺激2 h后,在血液TfMyD88表达量升高了近60倍,在皮肤中的表达量也升高了27倍。上述结果表明TfMyD88可能参与松江鲈先天免疫。
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文献信息
篇名
松江鲈(Trachidermus fasciatus)髓样分化因子MyD88基因克隆与组织表达分析
来源期刊
生物技术通报
学科
关键词
松江鲈
MyD88
基因克隆
先天免疫
LPS
年,卷(期)
2015,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
135-142
页数
8页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.02.020
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
祝茜
山东大学威海海洋学院
32
183
9.0
11.0
2
张秋霞
山东大学威海海洋学院
2
3
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陈学昭
山东大学威海海洋学院
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于珊珊
山东大学威海海洋学院
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毕彩红
山东大学威海海洋学院
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刘春影
山东大学威海海洋学院
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节点文献
松江鲈
MyD88
基因克隆
先天免疫
LPS
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
生物技术通报
主办单位:
中国农业科学院农业信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-5464
CN:
11-2396/Q
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区中关村南大街12号
邮发代号:
18-92
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7180
总下载数(次)
42
总被引数(次)
53964
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