新疆苹果树上苹果锈果类病毒(ASSVd)的检测与全序列分析

• 作者: 孙晓霞 牛建新 王钰婷
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果树 苹果锈果类病毒(ASSVd) 检测 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 页码范围: 693-698
• 页数: 6页
• 分类号: S436.611.1+4
• 字数: 3498字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2015.04.017

摘要

[目的]检测并分析新疆223团场多年生苹果树上的苹果锈果类病毒.[方法]对采自新疆库尔勒223团的多年生苹果树的枝条、叶片、果实((果皮、种子))样品进行RNA提取,利用RT-PCR技术检测鉴定.[结果](1)多年生的‘金冠’苹果树上检测到苹果锈果类病毒,得到4条克隆序列(ASSVd Y1:KC110858;ASSVd Y6:KC110859;ASSVd Y8:KC110860;ASSVd Y10:KC110861),所得序列与GenBank中已报道的国内外ASSVd序列同源性达85％以上.(2)序列比对可知,4条‘金冠’分离物序列之间只有3个碱基变异,与首次登录生物X17696有26个碱基变异,其中有4个碱基缺失和5个碱基插入,且变异多集中在类病毒序列的TL与TR区.[结论]通过序列分析比对,各寄主上的ASSVd分离物核酸序列变异较小,建立了优化的RT-PCR检测方法,为苹果树ASSVd的快速检测奠定了良好的基础.