苹果锈果类病毒RNA序列的生物信息学分析

• 作者: 王海波 陈建刚
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 类病毒 苹果锈果类病毒 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 所属期刊栏目: 农业灾害防御
• 页码范围: 4112-4114,4125
• 页数: 4页
• 分类号: S436.611.1~+5
• 字数: 2251字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2010.08.107

摘要

[目的]为苹果锈果类病毒结构域功能的关系、复制机制、变异与进化的研究提供理论依据.[方法]应用生物信息学的方法,得到一系列苹果锈果类病毒的RNA序列,对比其核苷酸数目、碱基组成比例,并进行了多重系列对比及二级结构预测.[结果]来自不同地区的苹果锈果类病毒RNA和核苷酸数目分布在329～336 bp.其中核苷酸数为330 bp的种类占64.71%,其A的分布范围19.39%～20.61%,T的分布范围在18.79%～20.91%,G的分布范围在29.70%～30.61%,C的分布范围在30.00%～30.91%.用RNAstructure软件进行苹果锈果类病毒的二级结构预测,随着稳定能量级的逐渐增加,其碱基配对区逐渐减小,而茎环区却逐渐增加.[结论]RNA是生物生命活动不可或缺的重要生物大分子,其二级结构比一级结构具有更大的保守性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈建刚	曲靖师范学院生物资源与环境科学学院	13	20	3.0	3.0
2	王海波	曲靖师范学院生物资源与环境科学学院	21	75	5.0	8.0