大鲵虹彩病毒-LY株主要衣壳蛋白基因克隆和分子特征研究

• 作者: 周小愿 张星朗 贾秋红 韩亚慧 高宏伟
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 大鲵 虹彩病毒 主要衣壳蛋白 克隆 结构预测
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 水产·渔业
• 页码范围: 45-54
• 分类号: Q941
• 语种: 中文

摘要

为明确大鲵虹彩病毒-LY株主要衣壳蛋白(mcp)基因分子特征和中国不同CGSIV毒株mcp基因变异及病毒的系统进化关系.克隆了CGSIV-LY株mcp基因,并运用生物信息学软件对获得的基因信息进行了分析.结果表明CGSIV-LY株mcp基因全长1392 bp,可编码463个氨基酸.预测蛋白质分子量为50.03ku,理论等电点是5.75,为亲水性可溶蛋白.CGSIV-LY株mcp不合有信号肽;没有跨膜区存在;抗原表位预测显示抗原性良好;结构预测显示,存在8个潜在的N-糖基化位点,存在17个潜在的O-糖基化位点和20个潜在的磷酸化位点.CGSIV-LY株mcp二级结构中无β-折叠,无规则卷曲占57.66％,延伸链占31.11％,α-螺旋占11.23％,主要以延伸链和无规则卷曲为主.氨基酸序列包含3个结构域:氨基酸N末端,氨基酸C末端和capsid_NCLDV保守区结构域,并在氨基酸序列的第414～436区存在一个低复杂度域.氨基酸序列多重比对和基于mcp氨基酸序列构建的蛙病毒属成员系统进化树分析结果显示,包括CGSIV-LY株在内的中国出现的不同CGSIV毒株之间mcp基因差异很小,为平行进化关系,共同聚为蛙病毒属成员独立的一支.中国出现的不同CGSIV毒株mcp基因应具有基本一致的分子结构和特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周小愿	中国水产科学院黄河水产研究所	17	81	5.0	7.0
2	韩亚慧	中国水产科学院黄河水产研究所	13	55	5.0	6.0
3	张星朗	中国水产科学院黄河水产研究所	14	64	5.0	7.0
4	贾秋红	中国水产科学院黄河水产研究所	13	53	4.0	6.0
5	高宏伟	中国水产科学院黄河水产研究所	14	59	5.0	6.0