江西省风疹病毒E1基因特性与疫苗株基因差异分析

• 作者: 刘丽 吴建英 张艳妮 朱丰秀 熊英 龚甜
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 风疹病毒 E1基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 分子诊断与基因检测
• 页码范围: 1220-1222
• 页数: 3页
• 分类号: R373.1+1
• 语种: 中文

摘要

目的 研究江西省2006年-2012年风疹病毒毒株的基因特性,为江西省的风疹防治策略提供科学依据.方法 采集风疹疑似病例咽拭子标本进行病毒分离,对分离到的风疹病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒E1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar 5.0、BioEdit 7.0、Mega 3.0生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析.结果 江西省2006年-2012年共分离到13株风疹毒株,均为麻风疹1E基因型,为本省风疹病毒本土野毒株.各分离株之间E1基因核苷酸同源性为97.8％～100％,氨基酸同源性为98.8％～100％;与疫苗株BRDⅡ株(RVi/Beijing.CHN/80)核苷酸同源性为89.3％～89.7％,氨基酸同源性为98.8％ ～99.6％,大部分核苷酸的突变为无义突变,氨基酸序列比较保守.结论 江西省2006年-2012年风疹病毒分离株为1E基因型,我国风疹疫苗株BRDⅡ株在分子水平上对本省疫苗保护效果较好.