江西省汉滩型汉坦病毒分离株AYW89-15全基因组序列分析

• 作者: 刘师文 刘晓庆 周珺 张艳妮 徐刚 施勇 李健雄 熊英 肖芳 龚甜
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 汉滩型汉坦病毒 全基因组 基因分型
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1089-1093
• 页数: 5页
• 分类号: R373
• 字数: 3150字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2017.12.007

摘要

目的 了解江西省汉滩型汉坦病毒(Hantaan virus,HTNV) AYW89-15株的全基因组序列特征.方法 设计和运用引物,采用RT-PCR方法分段扩增AYW89-15株的S、M、L全基因,对扩增产物进行克隆和序列测定.运用DNAstar和MEGA6.0软件分析基因序列.结果 AYW89-15株全基因组共有11 848个核苷酸,其中S、M、L基因分别含1 699、3 616、6 533个核苷酸,分别编码429、1 135、2 151个氨基酸.经序列比对,该病毒与国内外HTNV核苷酸同源性为79.7％～87.3％;氨基酸序列同源性为92.3％～98.4％.系统进化分析表明,AYW89-15株在HTNV系统进化树中独立分支.结论 AYW89-15株为HTNV新的基因亚型,江西省存在新基因亚型的HTNV.