甘蓝型油菜防御素基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 张涛 白瑞英 郑小敏 郭楠 陆俊杏 高天姝 黄兴琳 龚慧明
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘蓝型油菜 植物防御素 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 108-112
• 分类号: Q75
• 语种: 中文

摘要

为了研究甘蓝型油菜防御素基因的结构和功能,根据白菜防御素基因序列设计引物,采用RT-PCR方法从甘蓝型油菜中克隆到4个防御素基因,并对其序列进行了生物信息学分析.结果表明,甘蓝型油菜防御素基因cDNA全长325～335 bp,包含231～243 bp的开放阅读框,编码76～80个氨基酸;防御素基因在长期进化过程中产生了显著的差异,但防御素含有的8个保守半胱氨酸残基均稳定存在;Bndefl、Bndef2、Bndefe3与萝卜Rs-AFP1、诸葛菜Omdef亲缘关系较近,Bndef4与豇豆Vudef亲缘关系较近;4个防御素蛋白均为稳定蛋白,具有信号肽结构,可能为分泌蛋白.