山羊痘病毒A11 R基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吴健 吴国华 吴娜 张强 张志东 朱海霞 李健 李影 赵志荀 赵银龙 颜新敏
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 羊痘病毒 A11R 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医?水产养殖
• 页码范围: 158-163
• 页数: 6页
• 分类号: S827
• 字数: 3568字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2016.01.024

摘要

为了分析绵羊痘病毒A11R蛋白质的分子特征，提取了山羊痘病毒古浪分离株（ GL）的基因组DNA，设计引物进行PCR扩增，将PCR产物连接到pGEM?T Easy载体后转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞，筛选阳性克隆进行序列测定，利用生物信息学软件对A11R基因序列进行预测分析。结果显示，A11R基因序列由954个核苷酸组成的开放阅读框，编码317个氨基酸残基组成的多肽，蛋白质分子质量的理论值为36091．7，理论等电点为5?14。 A11R蛋白质的二级结构中，α螺旋占29?02％，β折叠占10?41％，其余60?57％为无规则卷曲。多序列比对分析显示，不同羊痘病毒分离株A11R序列高度保守，同源性在98％以上。进化树分析结果显示，GL株与NK株、TU株以及SA株在一个分支，说明它们之间具有较近的亲缘关系，上述研究结果为进一步研究A11R蛋白质的生物学功能和羊痘病毒早期蛋白质分子间相互作用奠定了基础。