金钱鱼MHC Ⅱ β基因结构、多态性与组织表达分析

• 作者: 刘至治 张俊彬 张璐菲 李强 王晓冰
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 金钱鱼 MHC Ⅱ β基因 基因结构 多态性 组织表达
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 21-33
• 页数: 13页
• 分类号: S917
• 字数: 7053字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2016.15300

摘要

为探究金钱鱼(Scatophagus argus)MHC Ⅱ β基因的结构和特性,采用同源克隆和RACE等技术,在获得cDNA全序列的基础上,分析其内含子序列、基因多态性和组织表达情况.结果表明,金钱鱼MHC Ⅱ β基因cDNA序列全长1172 bp,其中5'UTR长34bp,3'UTR长388 bp,开放阅读框(ORF)长750 bp,编码249个氨基酸,包含信号肽、β1结构域、β2结构域、连接肽(CP)、跨膜区(TM)和胞质区(CYT);MHC Ⅱ β基因由6个外显子和5个内含子组成,其中内含子3将β2结构域分开.从43尾金钱鱼的209个有效克隆中,获得209条不同的核苷酸序列,可归为48个等位基因主型,分别命名为Scar-DXB*0101～Scar-DXB*4801,揭示金钱鱼MHC Ⅱ β基因的多态性很丰富.RT-PCR检测发现,金钱鱼MHC Ⅱ β基因在所检测的11种组织中均有表达,其中在脾、鳃、肠和皮肤中表达量较高,在肾、胃、心脏表达量中等,而在眼、脑、肝、肌肉中表达量较低.对健康金钱鱼人工感染嗜水气单胞菌后,发现其MHC Ⅱ β基因在肝、脾、鳃、肾等组织中的表达量均发生了不同程度的变化,证明该基因在金钱鱼免疫反应中有重要作用.在NJ法构建的系统树中,金钱鱼与舌齿鲈、大西洋鲑等硬骨鱼类的亲缘关系相对较近,而与铰口鲨、原鸡、小鼠、人等的亲缘关系则依次渐远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘至治	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	15	109	6.0	10.0
2	李强	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	5	17	3.0	4.0
3	张俊彬	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	20	182	7.0	13.0
4	王晓冰	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	1	6	1.0	1.0
5	张璐菲	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	1	6	1.0	1.0