白色杜洛克×二花脸资源家系猪血液性状的系统遗传学研究

• 作者: 崔磊磊 张震 徐盼 杨斌 段艳宇
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 血液性状 肌肉 表达数量性状位点 全基因组关联分析 候选基因
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 232-240
• 页数: 9页
• 分类号: S828|S813.3
• 字数: 6189字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.02.004

摘要

为揭示家猪血细胞性状的遗传基础,本研究整合白色杜洛克×二花脸猪F2资源家系肌肉血细胞性状eQTL和全基因关联分析结果,鉴别影响血细胞性状的候选基因.研究测定了1 149个个体的18种血常规和593个个体肌肉转录本表达水平,对1 020个个体进行基因分型.转录组表达水平与血常规数据的关联性使用斯皮尔曼系数进行评估,将血细胞性状相关联的转录本进行eQTL定位并进行基因富集分析,结合前期本试验的GWAS结果进行综合分析.结果,当P＜5×10-4时检测到血细胞相关的eQTLs有122个,其中有9个顺式eQTLs和63个反式eQTLs.通过eQTL定位确定SERPINB6为影响红细胞性状的候选基因,基因富集分析鉴别到影响红细胞性状的候选基因为PTPRC和ITGA8,GWAS和eQTL的综合分析发现影响红细胞性状相关的基因为TMED9、PCK1、TINAGL1和SORL1.本研究通过结合前期GWAS结果和肌肉转录本表达数据进行综合分析鉴别到7个与红细胞性状相关的基因,其中TMED9、PCK1、TINAGL1和SORL1是GWAS和eQTL共有的候选基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐盼	江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室	3	7	2.0	2.0
2	张震	江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室	6	12	3.0	3.0
3	崔磊磊	江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室	1	3	1.0	1.0
4	杨斌	江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室	4	7	2.0	2.0
5	段艳宇	江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室	7	12	3.0	3.0