中国荷斯坦牛FADS2基因3'端SNP突变对乳中脂肪酸组成的影响

• 作者: 刘贤慧 夏海磊 张慧敏 张玉锋 徐晨希 朱小瑞 杨章平 王小龙 王梦琦
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 中国荷斯坦牛 FADS2 SNPs 脂肪酸组成
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·资源昆虫
• 页码范围: 2194-2202
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2016.11.015

摘要

[目的]FADS2是多不饱和脂肪酸合成中关键的限速酶之一,可催化食物中亚油酸(LNA,C18∶2n6)合成γ-亚麻酸(GLA,C18∶3n6)、二十碳五烯酸(EPA,C20∶5n3)、二十二碳六烯酸(DHA,C22∶ 6n3)等长链脂肪酸.试验旨在探讨中国荷斯坦牛FADS2基因3'端非编码区SNP突变对乳中脂肪酸含量的影响.[方法]随机选择20头无亲关系的中国荷斯坦牛样本,用直接测序列法检测FADS2基因3'端非编码区SNP突变位点.再以江苏某大型奶牛场5 51头中国荷斯坦牛为材料,用飞行时间质谱法对前期发现的2个SNP位点进行检测,同时利用最小二乘模型分析了SNP突变及其单倍型对乳中脂肪酸含量及其不饱和指数的影响.[结果]中国荷斯坦牛FADS2基因3'端非编码区存在3个SNP突变位点:c.1571 A＞G、c.2743 A＞G、c.2776 A＞G.c.1571 A＞G位点GG型为优势基因型,基因型频率为0.800,G为优势等位基因,基因频率为0.887.c.2776 A＞G位点AA为优势基因型,基因型频率为0.673,A为优势等位基因,基因频率为0.819.x2检验表明:c.2776 A＞G位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05),而c.1571 A＞G位点基因型分布均偏离Hardy-Weinberg平衡(P＜0.05).FADS2基因c.1571A＞G位点与c.2776 A＞G位点间连锁不平衡系数r2为0.028,未达到显著水平(P＞0.05).c.1571A＞G位点与c.2776 A＞G位点有3种单倍型,GA、GG和AA频率分别为0.705、0.181和0.114.多因素方差分析表明:FADS2-1571对C14∶1含量、C14和C18不饱和指数的影响达到极显著水平(P＜ 0.01),对C18∶0、SFA和MUFA含量的影响达到显著水平(P＜0.05).GG型个体乳中C14∶1含量、C14和C18不饱和指数显著高于AG型(P＜0.05).FADS2-2776位点对C16∶1含量、C16和C20不饱和指数的影响达到极显著水平(P＜0.01),对C14∶1含量的影响达到显著水平(P＜ 0.05),GG型个体乳中C16∶1含量、C16和C20不饱和指数显著高于AG型和AA型(P＜ 0.05).同时,FDAS2-1571-2776单倍型对C16∶1含量和C20不饱和指数的影响达到显著水平(P＜0.05),单倍型GG型个体乳中C16∶1含量和C20不饱和指数显著高于GA型和AA型(P＜0.05).[结论]FADS2基因3 '端非编码区SNP突变对中国荷斯坦牛乳中脂肪酸组成有重要影响.在进一步验证其功能情况下,可作为影响中国荷斯坦奶牛乳脂肪酸组成的主效基因加以利用.