亚洲棉和雷蒙德氏棉MATE基因家族生物信息学及其同源基因在陆地棉中的表达分析

• 作者: 吴楠 林毅 沈知临 蔡永萍 许磊 陈文 高俊山
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 亚洲棉 雷蒙德氏棉 陆地棉 MATE基因家族 基因结构 系统进化分析 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 215-226
• 页数: 12页
• 分类号: S562.03
• 字数: 5943字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201603004

摘要

多药和有毒化合物排出(MATE)蛋白家族是1个次级转运蛋白家族.为了更好地了解亚洲棉和雷蒙德氏棉中MATE蛋白的种类和数量,利用2种二倍体棉花基因组的氨基酸和cDNA数据库对MATE基因家族进行筛选,并分析亚洲棉和雷蒙德氏棉全基因组中MATE基因的种类和进化关系.结果显示,在亚洲棉基因组中初步鉴定了34个MATE基因,而在雷蒙德氏棉中筛选出42个MATE基因.基因结构和系统进化的比较分析表明,进化关系近的MATE基因在结构上基本是一致的.同时对陆地棉中克隆的GhTT12及与其同一族的部分MATE基因进行荧光定量分析,推测其所在同一族的MATE基因功能可能与转运原花青素有关.这些结果为进一步深入分析棉花MATE基因的功能以及在原花青素转运中的作用提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡永萍	安徽农业大学生命科学学院	167	2775	29.0	45.0
2	林毅	安徽农业大学生命科学学院	139	2078	27.0	38.0
3	高俊山	安徽农业大学生命科学学院	21	176	5.0	13.0
4	吴楠	安徽农业大学生命科学学院	7	44	4.0	6.0
5	沈知临	安徽农业大学生命科学学院	4	13	2.0	3.0
6	许磊	安徽农业大学生命科学学院	6	17	3.0	4.0
7	陈文	安徽农业大学生命科学学院	4	17	3.0	4.0