基于全基因组关联分析研究的2型糖尿病局部基因网络构建初探

• 作者: 赵禾苗 陈大方
• 来源期刊: 中国慢性病预防与控制
• 学科: 医学
• 关键词: 糖尿病,2型 基因网络 生物通路
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 97-101
• 页数: 5页
• 分类号: R587.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16386/j.cjpccd.issn.1004-6194.2016.02.005

摘要

目的 基于全基因组关联分析(GWAS)的研究结果,初步建立一个2型糖尿病易感基因的局部基因网络图,为今后的基因-基因交互作用,基因-环境交互作用的研究提供参考.方法 该研究的65个候选基因选自经过GWAS研究获褥统计学关联的2型糖尿病易感基因,从中选取具有2个或以上通路的目标基因27个,并通过通路的筛选、中间基因的选取,构建局部基因网络,并利用AiCS6软件绘制网络图.网络构建由以下步骤构成:(1)通过KEGG、Genecards数据库获取基因和通路的基本信息;(2)建立初级基因网络;(3)选取中间基因;(4)构建基因二级连接;(5)构建局部基因网络并绘制网络图.结果 获得了1个包括27个易感基因和10个中间基因以及一系列连接基因和中间分子的局部基因网络图,该网络包含20条生物通路.结论 该研究所得的局部基因网络图较为直观和综合地展示β细胞功能减退和胰岛素抵抗易感基因之间的相互关系,可对深入研究2型糖尿病分子病因机制提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈大方	北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系	82	534	12.0	17.0
2	赵禾苗	北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系	2	2	1.0	1.0