枣抑制消减cDNA文库构建与分析

• 作者: 冯延芝 张琳 李芳东 段经华 魏琦琦
• 来源期刊: 经济林研究
• 学科: 农学
• 关键词: 枣 抑制消减杂交 cDNA文库 生物信息学分析 功能注释
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 20-24
• 页数: 5页
• 分类号: S665.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.14067/j.cnki.1003-8981.2016.04.004

摘要

枣树具有独特的开花结果特性，为获得枣花发育基因，以金丝4号枣不同发育时期的花蕾和同时期的叶片cDNA互为试验方和驱动方，利用抑制消减杂交技术分别构建了枣花和枣叶抑制消减杂交cDNA文库（SSH文库）。枣花和枣叶SSH文库重组率分别是92.05%和90.26%，插入片段长度均介于200～2000 bp之间，主要集中于1000 bp左右。分别从枣花和枣叶SSH文库中随机挑选1000个阳性克隆进行DNA测序、组装拼接，结果显示枣花SSH文库中获得96条unigene，其中contigs 43个，singletons 53个，96条unigene预测得到73个ORF，经过同源比对分析获得有注释的序列20条，按功能分为7类；枣叶SSH文库中获得86条unigene，其中contigs 45个，singletons 41个，86条unigene预测得到70个ORF，经过同源比对分析获得有23条注释的序列，按功能分为6类。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李芳东	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	55	757	15.0	24.0
2	段经华	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	14	134	6.0	11.0
3	魏琦琦	中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室	4	10	2.0	3.0
12	冯延芝	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	1	2	1.0	1.0