赤眼鳟TRAF6基因的cDNA克隆及其应对GCRV的免疫表达特性

• 作者: 刘巧林 徐莹 王荣华 王静安 肖调义 赵鑫 陈开健
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 赤眼鳟 肿瘤坏死因子受体相关因子6基因 草鱼呼肠孤病毒(GCRV)
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧?兽医?水产
• 页码范围: 641-646
• 页数: 6页
• 分类号: Q785|S965
• 字数: 3362字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2016.06.011

摘要

为研究赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)肿瘤坏死因子受体相关因子6基因的结构特性及其应对GCRV的免疫表达特性，采用RACE技术获得了赤眼鳟TRAF6基因的cDNA全长(共2621 bp)，其中包含5′端非编码区50 bp，开放阅读框1629 bp，3′端非编码区942 bp；该基因编码542个氨基酸，推导的蛋白质相对分子质量为61670，理论等电点为6.01。SMART结构分析结果显示，TRAF6基因编码的蛋白包含1个RING结构域、2个锌指结构域、1个螺旋卷曲结构域和1个MATH结构域。系统进化树分析结果表明，赤眼鳟TRAF6与团头鲂TRAF6的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果显示，TRAF6在赤眼鳟的12种组织中均有表达，其中在肝脏中的表达量最高，在中肠中的表达量最低；经GCRV感染后，赤眼鳟脾脏和头肾中TRAF6均呈波动上调趋势，在24 h达到峰值，表明TRAF6参与了赤眼鳟抗GCRV的免疫应答反应。