植物活性长末端重复序列反转录转座子研究进展

• 作者: 周明兵 梁琳琳
• 来源期刊: 生物工程学报
• 关键词: 长末端重复序列反转录转座子 转座 LTR gag pol
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 409-429
• 语种: 中文
• DOI: 10.13345/j.cjb.150279

摘要

长末端重复序列(Long terminal repeat,LTR)反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类可移动的DNA序列,它们以RNA为媒介,通过“复制粘贴”机制在基因组中不断自我复制.在高等植物中,许多活性的LTR反转录转座子已被详尽研究并应用于分子标记技术、基因标签、插入型突变及基因功能等分析.本文对植物活性LTR反转录转座子进行全面的调查,并对其结构、拷贝数和分布以及转座特性进行系统的归纳,分析了植物活性LTR反转录转座子的gag(种属特异抗原)和pol(聚合酶)序列特征,以及LTR序列中顺式调控元件的分布.研究发现自主有活性的LTR反转录转座子必须具备LTR区域以及编码Gag、Pr、Int、Rt和Rh蛋白的基因区.其中两端LTR区域具有高度同源性且富含顺式调控元件;Rt蛋白必备RVT结构域;Rh蛋白必备RNase_H1_RT结构域.这些结果为后续植物活性LTR反转录转座子的鉴定和功能分析奠定了重要基础.