一株柯萨奇病毒A9分离株的VP1基因遗传特征分析

• 作者: 俞泽煦 张海浩 朱艳菊 杨舜乔 王晓辉 白巍 邵聪文 马绍辉
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒A9 VP1基因 遗传特征
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 18-22
• 分类号: R373.2+3|Q75
• 语种: 中文

摘要

目的 分析引起病毒性脑炎(viral encephalitis,VE)的一株柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)A9分离株(CVA9)的VP1基因遗传特征.方法 采用KMB17细胞对VE患儿粪便标本进行病毒分离,利用RT-PCR法从分离的病毒中扩增VP1全基因,并测序,采用Mega6.1和Geneious 5.6.5等软件分析其序列,并构建系统进化树.结果 从5份VE患儿粪便中分离到一株人CVA9,命名为A108/YN/CHN/2009,其全长VP1基因的核苷酸长度与其他CVA9一致,均为906 bp.与中国其他分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为88.4％ ～ 98.2％和96.4％ ～ 99.3％,而与国外分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.0％ ～ 96.0％和92.7％ ～ 99.0％.在进化树上与其他中国分离株属同一分支中不同两个亚分支,与JB141230009亲缘关系较近.结论 A108/YN/CHN/2009分离株为肠道病毒CVA9血清型,与其他中国分离株同属一个基因簇.