人冠状病毒HKU1 Spike蛋白受体结合域结构预测

• 作者: 周卫红 张伟 王俊虹 王爱昕 胡役兰 赵国平 陶靖隆 魏茂提
• 来源期刊: 武警后勤学院学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 蛋白质结构预测 同源建模 穿线法 人冠状病毒HKU1 Spike蛋白 受体结合域
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 421-423,427,封2
• 页数: 5页
• 分类号: R774.1
• 语种: 中文

摘要

[目的]探索人冠状病毒HKU1(human HKU1 coronavirus,hHKU1-CoV)Spike蛋白受体结合域(receptor binding domain,RBD)蛋白结构.[方法]利用已经发表的hHKU1-CoV Spike基因序列,通过蛋白建模获得该冠状病毒Spike空间结构,运用PDBsum平台进行蛋白结构分析.[结果]人冠状病毒HKU1-CoV Spike氨基酸序列(No.AGW27881.1) 535 ～673位可能存在RBD,二级结构显示该区域共有4个β折叠股、6个α螺旋,2个β-α-β单元.蛋白质空间结构分析显示RBD可分为核心区和Loop区.核心区由2个平行的β折叠股和4个α螺旋顺序链接组成,Loop区位于核心区外围,由ASN589-PRO673之间氨基酸构成1个含有3个边缘的柔性区域和2个反向平行的β折叠共同组成的腔隙结构,该区域可能是hHKU1-CoV与宿主受体作用的关键部位.[结论]hHKU1-CoV Spike蛋白与宿主受体作用的关键部位可能位于SER606～PRO673,这与已知结构的β冠状病毒相同区域在Loop区存在差异,但冠状病毒受体尚需进一步探索.