妊娠期乳腺癌相关基因的生物信息学分析

• 作者: 卢严方 滕牧洲 陈利娜 马文丽
• 来源期刊: 解剖学报
• 学科: 医学
• 关键词: 妊娠期乳腺癌 基因芯片 差异表达基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 肿瘤生物学
• 页码范围: 348-352
• 分类号: R737.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.16098/j.issn.0529-1356.2016.03.010

摘要

目的 通过生物信息分析途径对妊娠期乳腺癌患者与正常人群的差异基因进行分析,从分子水平探讨妊娠期乳腺癌的发病机制.方法 从公共数据库基因表达数据库(GEO)中下载妊娠期乳腺癌相关数据集,采用Qlucore Omics Explore(QOE)筛选差异表达基因,用DAIVID、STRING等在线分析工具对差异表达基因进行功能富集分析,信号转导通路分析以及预测蛋白质之间的关系.结果 共筛选出148个差异表达基因,其中表达上调24个,下调124个,对其进行生物信息学分析发现,TAGLN、ACTG2、TPM2、TPM3、MYLK、ACTA2、MTH11等基因以及MAPK信号通路、黏着斑信号通路、血管平滑肌细胞收缩信号通路等在妊娠期乳腺癌的发生发展中可能起着重要作用.通过STRING分析发现,20个基因处于核心节点位置.结论 利用生物信息学的方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马文丽	南方医科大学基因工程研究所	275	1255	15.0	23.0
2	卢严方	南方医科大学基因工程研究所	3	25	2.0	3.0
3	滕牧洲	南方医科大学基因工程研究所	4	21	2.0	4.0
4	陈利娜	南方医科大学基因工程研究所	3	6	2.0	2.0