小鲵科动物Cytb基因密码子偏好性分析

• 作者: 姜艳 张全星 管德龙 许升全
• 来源期刊: 陕西师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 小鲵科 细胞色素b基因 密码子偏好性 系统发育
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 77-82
• 页数: 6页
• 分类号: Q953
• 字数: 3354字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15983/j.cnki.jsnu.2016.04.345

摘要

利用Mobyle在线工具的 CUSP 程序以及CodonW、Cluster3．0软件对NCBI数据库中16种小鲵科动物的细胞色素b（Cytochrome b，Cytb）基因密码子偏好性进行了分析，并探讨密码子偏好性对系统发育分析的影响。结果表明：16种小鲵科动物Cytb基因的有效密码子数范围为34．45～47．18，平均值为41．01，该基因有密码子使用偏好。该基因在组成上偏好使用以 A或 T碱基结尾的密码子。通过计算各物种每个密码子的同义密码子相对使用度值并做密码子和物种的分层聚类发现，在不同属间密码子使用的模式明显不同。基于Cytb基因密码子偏好性的物种聚类结果与基于Cytb基因序列构建的最大似然法和贝叶斯系统发育树结果不完全一致。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜艳	秦巴山区可持续发展协同创新中心陕西师范大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0
2	张全星	秦巴山区可持续发展协同创新中心陕西师范大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0
3	管德龙	秦巴山区可持续发展协同创新中心陕西师范大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0
4	许升全	秦巴山区可持续发展协同创新中心陕西师范大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0