番茄AT-hook基因家族的鉴定及胁迫条件下的表达分析

• 作者: 丁丽雪 徐小万 李植良 李涛 李颖 王恒明 王永飞 马三梅 黎振兴
• 来源期刊: 植物遗传资源学报
• 关键词: 番茄 AT-HOOK基因家族 生物信息学 基因表达 氧化胁迫
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 基因挖掘
• 页码范围: 303-315
• 语种: 中文
• DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.2016.02.016

摘要

AT-hook蛋白家族在植物生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用.本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄AT-hook基因家族的成员、分布、结构和功能进行分析.结果表明,番茄AT-hook家族包含32个成员,分为3种类型,其中类型Ⅰ含有13个成员;遗传进化分析表明番茄AT-hook基因成员与拟南芥家族基因具有相似分类.利用实时荧光定量PCR对番茄32个基因开展组织表达分析,结果表明AT-hook基因具有表达差异,主要在根和花中表达较高.氧化胁迫分析结果表明,32个基因受ABA、SA、盐、高温和低温诱导表达,其中部分基因显著上调或下调表达,很可能参与了番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应.本研究结果将为番茄AT-hook家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析番茄AT-hook基因的功能奠定基础.