白念珠菌Hog1基因DNA、mRNA、蛋白的生物信息学分析

• 作者: 乐秀 何泰龙 孙瑶 张静 梅碧琪 陈垦 高文超 黄丽林 黄怀球
• 来源期刊: 皮肤性病诊疗学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 白念珠菌 Hog1基因 生物信息
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 225-230
• 页数: 6页
• 分类号: R34|R756
• 字数: 4181字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8468.2016.04.003

摘要

目的:探讨白念珠菌Hog1基因DNA、mRNA、蛋白的潜在生物学性质.方法:采用生物信息学方法对白念珠菌Hog1基因DNA、mRNA、蛋白序列进行分析.结果:白念珠菌Hog1基因启动子可能位于其基因编码区起始位点前654 ～ 704 bp,转录起始位点为编码区起始位点前663 bp,Hog1基因并无内含子.Hog1基因mRNA中未发现核糖体结合位点等功能性RNA序列,RNA二级结构分析显示,Hog1mRNA形成稳定的回文结构.蛋白质的理化性质分析显示,Hog1蛋白稳定系数为35.67.TargetP 1.1和SignalP 4.1预测结果显示,Hog1基因不存在线粒体定位序列、分泌信号肽及跨膜区域.Motif分析显示Hog1具有MAPK活性,其活性位点可能为第189-181个氨基酸(TRY).Hog1蛋白序列在各物种间呈渐进式进化、较为保守,尤其在MAPK功能域附近.结论:白念珠菌Hog1基因的DNA和mRNA序列无常见功能域,可能主要通过其蛋白质发挥作用.Hog1蛋白是MAPK家族成员,其MAPK活性位点(第189-181个氨基酸TRY)或为潜在的药物靶点.