绵羊不同部位脂肪组织microRNA高通量测序及生物信息学分析

• 作者: 乔利英 刘建华 刘文忠 张方 景炅婕 李宝钧 潘洋洋 胡子乔
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绵羊 脂肪组织 microRNA Solexa测序 生物信息学方法
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1093-1101
• 页数: 9页
• 分类号: S813.3|S826
• 字数: 5771字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.06.003

摘要

本研究旨在挖掘绵羊不同脂肪组织中特异表达的miRNAs.构建肾周(PEF)、皮下(SUF)和尾部(TAF)脂肪组织的3个小RNA文库,利用Solexa测序技术进行测序,用Stem-loop qRT-PCR技术和生物信息学方法对测序结果进行验证和分析.结果表明,8个随机选择的miRNAs中有7个miRNAs的表达与测序结果一致.在肾周和皮下脂肪组织的sRNA文库中分别检测到128和112个保守miRNAs,分别发现198和196个新miRNAs.结合前期在尾脂中检测到miRNAs的分析结果,肾周脂肪中特异表达的有12个保守的和66个新miRNAs;皮下脂肪中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和30个;尾脂中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和34个.上述结果将为进一步研究miRNA调控绵羊的脂肪代谢提供科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘文忠	山西农业大学动物科技学院	86	476	11.0	18.0
2	刘建华	山西农业大学动物科技学院	32	193	8.0	12.0
3	李宝钧	山西农业大学动物科技学院	20	65	6.0	7.0
4	乔利英	山西农业大学动物科技学院	45	148	6.0	10.0
5	张方	山西农业大学动物科技学院	4	16	2.0	4.0
6	胡子乔	山西农业大学动物科技学院	5	17	2.0	4.0
7	潘洋洋	山西农业大学动物科技学院	12	30	3.0	4.0
8	景炅婕	山西农业大学动物科技学院	23	51	5.0	5.0