山羊肌肉组织microRNA Solexa测序与生物信息学分析

• 作者: 丁建平 凌英会 向浩 张子军 张晓东 张运海 李运生 殷捷 王丽娟
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 山羊 肌肉 microRNA 测序 特征
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 481-487
• 页数: 7页
• 分类号: S827.2
• 字数: 5039字
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在挖掘山羊肌肉组织miRNA,获取山羊肌肉组织miRNA表达谱并分析其生物学特征,为进一步研究特定miRNA参与山羊肌肉细胞的增殖与分化等生长发育机制奠定理论基础.从山羊肌肉组织中提取总RNA,分离、构建小片段RNA文库,利用Solexa方法进行测序并进行生物信息学分析,最后利用q-PCR技术验证miRNA在山羊肌肉组织中的表达情况.共鉴定出517个物种间保守的和2个山羊基因组特有的miRNA.其中306个表达量在100以上.随机选择8个miRNA,利用q-PCR验证其在山羊肌肉组织中的表达情况,结果与测序结果一致.同时miRNA靶基因预测和功能分析表明,很多miRNA可能影响一些与动物肌肉发育相关的细胞信号通路.测序成功获取了山羊肌肉组织miRNA序列及其表达谱,山羊肌肉组织miRNA表达丰富且表达量各异.本研究也为进一步研究miRNA调控哺乳动物肌肉发育奠定了理论基础.