牦牛不同年龄肌肉组织microRNA表达谱及生物信息学分析

• 作者: 信金伟 姬秋梅 柴志欣 王会 王吉坤 王嘉博 纪会 罗晓林 钟金城
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 肌肉组织 高通量测序 miRNA
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 957-971
• 页数: 15页
• 分类号: S823.85
• 字数: 7872字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.05.007

摘要

旨在挖掘牦牛不同年龄肌肉组织中miRNA表达谱,分析其生物学特征,以探索其在牦牛肌肉发育过程中的调节模式.本研究构建0.5、2.5、4.5和7.5岁肌肉组织的4个小RNA文库,利用Solexa技术进行测序,用生物信息学方法和RT-qPCR技术对测序结果进行分析和验证.结果,获得各miRNAs分别在4个年龄段肌肉组织中的表达量,在7.5岁肌肉组织中发现58个共同与0.5、2.5、4.5岁差异表达的miRNAs,其中53个miRNAs在7.5岁肌肉组织中显著下调,5个显著上调.运用R语言进行GO富集和KEGG信号通路分析,58个miRNAs可能通过PI3K-Akt、MAPK、Ras和肌动蛋白细胞骨架调节通路(regulation of actin cytoskeleton)参与调节牦牛肌肉细胞的增殖与分化,且PI3K-Akt、MAPK、Ras 3个信号通路共同靶向53个靶基因,说明3个信号通路相互关联.随机选择8个miRNAs进行RT-qPCR验证,结果表明其中7个miRNAs的表达趋势与测序结果一致.结果表明,牦牛肌肉发育可能受到多种miRNA的调控并涉及多个信号通路,有助于构建肌肉组织中miRNA的调控网络,为进一步研究miRNA调控哺乳动物肌肉发育奠定了理论基础.