陆地棉CAD基因家族的进化和表达分析

• 作者: 张经博 李波 杨洋 胡文冉 范玲 谢丽霞 陈方圆
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 棉纤维 CAD基因家族 系统进化分析 表达分析 cad5突变体 根毛
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 页码范围: 1177-1187
• 页数: 11页
• 分类号: S562|S188
• 字数: 7025字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2016.07.001

摘要

[目的]对陆地棉CAD基因家族成员进行进化和表达分析,了解其在棉纤维发育中的作用.[方法]应用生物信息学方法,从棉花基因组中筛选出21个CAD基因,并对CAD的基因结构、染色体分布、基因倍增模式以及系统进化进行分析.利用深度表达数据分析CAD基因在棉纤维发育各时期的表达.对比观察拟南芥cad5突变体和野生型根毛表型.[结果]同源性高的CAD基因复制对之间有相似的基因结构;片段重复和串联重复是CAD基因扩增的主要方式.进化分析可知,CAD基因可分为七个亚组,且功能相近的基因聚类在相同亚组.利用深度测序表达数据分析可知,CAD基因在棉纤维各个发育时期均有表达.对比拟南芥cad5突变体和野生型根毛发现,突变体相比于野生型有更长的根毛.[结论]CAD基因参与了棉纤维的发育的过程,并对棉花纤维发育起到一定的调控作用.