牙囊干细胞成骨分化基因调控网络的生物信息学分析

• 作者: 李凌志 王睿 郭建青 麻鹏
• 来源期刊: 实用口腔医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 牙囊干细胞 成骨分化 调控网络 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 480-484
• 页数: 5页
• 分类号: Q786
• 字数: 3684字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3733.2016.04.007

摘要

目的：应用生物信息学分析牙囊干细胞（DFSCs）成骨分化过程中基因调控网络。方法：从 GEO Datasets 数据库获取在 DFSCs 成骨分化过程中差异表达的基因。应用 DAVID 和 GeneMANIA 数据库对这些基因的关系进行分析。结果：从 GEO Datasets 数据库获得了大量 DFSCs 成骨分化过程中差异表达的基因，对差异表达明显（P ＜0．05）的289个基因进行分析，富集到“细胞分化”、“细胞增殖”、“骨骼系统发育”、“钙信号通路”等基因子集。其中 ALPL、CTSK、TUFT1、TGFBR2、FHL2、ROR2、STC1、POSTN，ZBTB16、FRZB、PRELP、IGFBP5等12个基因被富集在“骨骼系统发育”子集，这12个基因通过共表达、共定位、遗传学相互作用等彼此关联并与其它信号通路相联系。结论：DFSCs 成骨分化中许多差异表达的基因间存在相互作用的分子网路。需要从 WNT、TGFbeta、MAPK 等信号通路、同源盒转录因子及成骨分化标记物基因的整体关系上来认识 DF-SCs 成骨分化。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭建青	上海市徐汇区大华医院口腔科	10	41	3.0	6.0
2	王睿	上海市徐汇区大华医院口腔科	2	2	1.0	1.0
3	麻鹏	上海交通大学医学院附属瑞金医院古北 口腔科	2	2	1.0	1.0
4	李凌志	复旦大学附属华山医院口腔科	2	5	2.0	2.0