小鼠心脏发育相关基因调控网络的生物信息学分析

• 作者: 张慧 陆祖宏
• 来源期刊: 生物医学工程研究
• 学科: 医学
• 关键词: 小鼠 心脏发育 基因调控网络 生物信息学 转录因子
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 95-100
• 分类号: R318
• 字数: 4456字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-6278.2011.02.007

摘要

Nkx2.5,Mef2c,Gata4/5/6,Tbx5和Hand1等基因作为脊椎动物心脏发育相关基因调控网络的核心基因,对脊椎动物的心脏发育起核心调控作用.本研究主要通过对小鼠心脏发育相关核心基因的生物信息学分析,研究Nkx2.5,Mef2c,Gata4,Gata6,Tbx5和Hand1等核心转录因子之间的相互调控关系,得到小鼠心脏发育的核心基因调控网络(GRNs).与文献中总结的小鼠的GRNs作比较,发现Nkx2.5在小鼠心脏发育基因调控网络中的核心地位没有改变,并且Nkx2.5在网络中主要扮演了调控者的角色,它直接调控很多转录因子.Gata4是另一个主要起调控者作用的转录因子.另外小鼠的Mef2c和Hand1处于被多个转录因子调控的地位.变化比较大的是Tbx5所涉及的调控网络,主要有两点:Nkx2.5对Tbx5的表达有没有调控作用以及Tbx5对自身的表达有没有调控作用.研究表明生物信息学分析对具体实验研究有一定方向性指导意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张慧	东南大学生物电子学国家重点实验室	45	198	8.0	13.0
2	陆祖宏	东南大学生物电子学国家重点实验室	166	1602	19.0	33.0