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摘要:
Clp 蛋白酶是一种 ATP 依赖的丝氨酸型蛋白酶,广泛存在于原核和真核生物中,在生物抗逆胁迫中发挥重要作用。为分析花生中 Clp 基因的情况,我们构建了花生叶片转录组数据库,通过生物信息学手段鉴定出28个 Clp 基因,分别位于花生 A 组野生种的9条染色体上;聚类分析表明,花生的28个 Clp 基因分别聚到已报道的 ClpB、C、D、X、P、R 和 S 7个亚类中。利用花生耐盐突变体(S2)和对照(S4)构建了盐胁迫处理前后各时间段的表达谱数据,进行 Clp 基因盐胁迫表达分析,结果表明16个 Clp 基因在 S2和(或)S4中受盐胁迫诱导表达。该研究为花生 Clp 基因的功能研究与利用奠定基础。
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文献信息
篇名 花生 Clp 家族成员的筛选、聚类和盐胁迫响应分析
来源期刊 山东农业科学 学科 农学
关键词 花生 Clp 基因 RNA 测序 盐胁迫
年,卷(期) 2016,(12) 所属期刊栏目 生物技术?遗传育种?种质资源
研究方向 页码范围 1-5
页数 5页 分类号 S565.203.53
字数 3770字 语种 中文
DOI 10.14083/j.issn.1001-4942.2016.12.001
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 隋炯明 青岛农业大学生命科学学院 19 92 5.0 9.0
2 赵春梅 青岛农业大学生命科学学院 13 38 4.0 5.0
3 乔利仙 青岛农业大学生命科学学院 21 124 6.0 10.0
4 王晶珊 青岛农业大学生命科学学院 32 149 6.0 10.0
5 孔祥远 青岛农业大学生命科学学院 2 0 0.0 0.0
6 陈冠旭 青岛农业大学生命科学学院 1 0 0.0 0.0
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RNA 测序
盐胁迫
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