花生膜联蛋白基因家族成员的结构和表达分析

• 作者: 王慧敏 李新国 万书波 张智猛 丁红 李国卫 高文伟 彭振英
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 花生 膜联蛋白 基因结构分析 可变剪切分析 表达模式分析
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 390-400
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.84056

摘要

植物膜联蛋白(annexin)是一类钙依赖性磷脂结合蛋白，参与调控植物代谢和生长发育并协同调节抗旱、耐盐等多种抗逆反应，其结构在不同植物中具有物种特异性。为系统分析花生膜蛋白基因家族，对30个花生annexin(annexin of Arachis hypogaea，AnnAh)基因进行了生物信息学分析。结果表明30个AnnAhs不均匀分布在13条染色体上，其中A、B基因组中各有13个和17个。AnnAhs含有2~8个内含子，但大多数含有5~6个内含子。聚类分析表明，植物annexin聚类关系比较复杂，低等植物、单子叶、双子叶植物annexin间隔分布，AnnAhs穿插其中，分布于各个分支中;但在各个小分支中，AnnAhs基本上都与双子叶植物annexin聚在一起，其中与大豆、苜蓿、向日葵亲缘关系较近，其次是拟南芥;但个别AnnAhs与单子叶植物和低等植物annexin聚在一起。30个AnnAhs均无跨膜结构域，其中有16个AnnAhs定位于细胞质，其余定位不明确。对AnnAhs可变剪切分析显示，仅有11个发生可变剪切事件，占38%;根中发生的最多，其次是叶中，种子中最少。根据表达谱数据分析发现，AnnAhs在seed2和根中表达量较高，其次是seed1，在叶中表达量较低。本文可为花生抗性育种提供一定的理论支撑。