花生蛋白磷酸酶2C家族基因的鉴定和盐胁迫响应分析

• 作者: 乔利仙 李恩广 王晶珊 秦贵龙 赵春梅 陈冠旭 隋炯明
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 花生 PP2C基因 盐胁迫 顺式调控元件
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 71-77
• 页数: 7页
• 分类号: Q785
• 字数: 3868字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.03.012

摘要

为了分析花生中蛋白磷酸酶2C基因(PP2C)的情况,对耐盐花生突变体(S2)和对照(S4)在胁迫处理前后的叶片进行RNA-Seq分析.通过生物信息学分析筛选出了79个具有完整开放阅读框的PP2C基因,它们位于花生A组野生种的10条染色体上,不同染色体上的PP2C基因数目差异很大,分布为1～15个.根据拟南芥中的PP2C基因的聚类分析结果,79个花生PP2 C基因能聚到已报道的12个亚族15个亚类.为了分析这些PP2 C基因对盐胁迫响应情况,利用突变体S2和对照S4构建了盐胁迫处理前后的表达谱,筛选出35个受盐胁迫诱导表达的PP2C基因,涉及12个亚族14个亚类,其中A亚族b亚类、G亚族b亚类、I亚族、L亚族所有成员均受盐胁迫诱导表达;而G亚族a亚类的所有成员均不受盐胁迫诱导表达.对这35个PP2C基因的启动子研究发现,绝大多数PP2C基因的启动子存在多种胁迫响应元件:如与高温胁迫相关的调控元件HSE、与干旱诱导相关的MYB转录因子结合位点MBS、逆境胁迫应答元件TC-rich repeats、与抗氧化反应相关的ARE元件等.为花生PP2C基因的功能研究和利用奠定了基础.